Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrt4B2RU40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms