Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan5bB2RTN3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan5bB2RTN3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zscan5bB2RTN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms