Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rrn3B2RS91 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rrn3B2RS91 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rrn3B2RS91 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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