Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1B2KF50 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1B2KF50 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms