Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60cB1B213 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms