Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CK137956B1AYM9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CK137956B1AYM9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms