Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf25B1AWN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf25B1AWN9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf25B1AWN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms