Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d2B1AVH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2B1AVH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms