Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik3B1AS29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik3B1AS29 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms