Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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