Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2822.8 ms