Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll9A2APC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll9A2APC3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll9A2APC3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttll9A2APC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttll9A2APC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttll9A2APC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll9A2APC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms