Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1A2ANU3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms