Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Frmpd1A2AKB4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Frmpd1A2AKB4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Frmpd1A2AKB4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Frmpd1A2AKB4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Frmpd1A2AKB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms