Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lcn6A2AJB9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lcn6A2AJB9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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