Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brwd3A2AHJ4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms