Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd4A2AFR3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms