Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl1A2AFH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms