Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm16A2A935 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm16A2A935 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
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Prdm16A2A935 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prdm16A2A935 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm16A2A935 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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