Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprfA2A8L5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprfA2A8L5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms