Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hivep3A2A884 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hivep3A2A884 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hivep3A2A884 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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