Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm2A2A7B5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm2A2A7B5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms