Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap1-3A2A588 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-3A2A588 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms