Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nlrp1bA1Z198 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1bA1Z198 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrp1bA1Z198 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms