Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trav12-2A0N8N6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trav12-2A0N8N6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trav12-2A0N8N6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trav12-2A0N8N6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trav12-2A0N8N6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trav12-2A0N8N6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trav12-2A0N8N6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms