Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RNP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms