Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Alg13Q9D8C3 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Alg13Q9D8C3 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms