Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms