Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm10378F6XQQ1 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm10378F6XQQ1 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm10378F6XQQ1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm10378F6XQQ1 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm10378F6XQQ1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm10378F6XQQ1 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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