Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atg16l1Q8C0J2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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