Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cyp4f39Q8BGU0 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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