Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm13675-201ENSMUST00000120616 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm22881-201ENSMUST00000157747 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm8254-201ENSMUST00000182326 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm9999-201ENSMUST00000070660 486 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm45286-201ENSMUST00000209267 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm44992-210ENSMUST00000210126 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Camk2a-202ENSMUST00000039904 1734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm9855-201ENSMUST00000121229 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm37955-201ENSMUST00000195098 212 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Upp1-201ENSMUST00000020677 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Il18-204ENSMUST00000214117 860 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Clrn2-201ENSMUST00000053250 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Hmbox1-209ENSMUST00000176832 1586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Slc30a2-204ENSMUST00000105874 3153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 A530006G24Rik-201ENSMUST00000152542 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm14044-201ENSMUST00000117531 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ighv1-57-201ENSMUST00000194898 349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Copg1-201ENSMUST00000049966 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm29427-201ENSMUST00000188520 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms