Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CartptP56388 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms