Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm35618-201ENSMUST00000223164 1606 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Swt1-201ENSMUST00000064771 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 C2-205ENSMUST00000148431 1946 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 A430078G23Rik-201ENSMUST00000098966 2945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms