Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Parvb-201ENSMUST00000023072 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Upf2-201ENSMUST00000060092 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Asb3-201ENSMUST00000020551 3228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Vps11-201ENSMUST00000034644 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sfta2E9PXB6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms