Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Lpar1-204ENSMUST00000107574 3437 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Xpnpep2-203ENSMUST00000115000 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Creb5-201ENSMUST00000047450 2330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Nr5a2-203ENSMUST00000192357 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm2071-201ENSMUST00000193335 774 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms