Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Oacyl-202ENSMUST00000117694 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg16l1Q8C0J2 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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