Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm7776-201ENSMUST00000191211 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Igkv3-11-201ENSMUST00000197500 385 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm18745-201ENSMUST00000216018 548 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Isx-201ENSMUST00000034034 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms