Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Cdkl5-201ENSMUST00000087104 3269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Lpar1-204ENSMUST00000107574 3437 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm15448-204ENSMUST00000153846 2145 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Stx16-202ENSMUST00000087908 3865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ldb2-205ENSMUST00000199261 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dkk3-201ENSMUST00000033036 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms