Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm45757-201ENSMUST00000211835 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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