Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms