Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm13710-201ENSMUST00000126679 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmbim6-205ENSMUST00000160635 871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm16252-202ENSMUST00000215604 1232 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr1393-201ENSMUST00000078932 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45286-201ENSMUST00000209267 1350 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sag-201ENSMUST00000077772 1719 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm16485-201ENSMUST00000104915 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Bnip3-201ENSMUST00000106112 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm38390-201ENSMUST00000194859 1065 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-57-201ENSMUST00000194898 349 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm23405-201ENSMUST00000082542 160 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rad18-203ENSMUST00000113180 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gpatch4-202ENSMUST00000166021 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm8024-201ENSMUST00000167099 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Gm7951-201ENSMUST00000171388 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Snhg7os-201ENSMUST00000126798 546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm5499-201ENSMUST00000090731 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm36595-201ENSMUST00000218830 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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