Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc97Q9DBT3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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