Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Oacyl-202ENSMUST00000117694 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fam186b-201ENSMUST00000109100 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms