Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Sntg1-202ENSMUST00000115488 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Htr2b-201ENSMUST00000027431 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14182-201ENSMUST00000119334 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm20395-201ENSMUST00000173799 690 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm7545-201ENSMUST00000182773 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cd2-201ENSMUST00000029456 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gngt2-206ENSMUST00000107712 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14044-201ENSMUST00000117531 447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mif-ps3-201ENSMUST00000118636 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Btn2a2-202ENSMUST00000110432 2089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Trim43b-201ENSMUST00000167113 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Gm16291-201ENSMUST00000147378 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a3Q9JLI2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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