Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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