Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Gm44992-210ENSMUST00000210126 1330 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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