Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zeb2-215ENSMUST00000200844 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12154-201ENSMUST00000145584 445 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm3466-201ENSMUST00000181797 1192 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms