Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt8P11679 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Krt8P11679 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt8P11679 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms