Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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